Okajima Rokuro egy fiatal japán üzletember, aki egy fontos megbízást kapott a cégétől. Egy CD-t kell eljuttatnia Borneóba, viszont a hajóút alatt egy kalózbanda megtámadja a hajót, és megszerzik a lemezt. A kalózok megbízása eredetileg a lemez beszerzéséig terjed, de Revy kevesli a 20.000-ret, amit a megbízásért kapnak, ezért magukkal viszik Okajimát, mivel abban bíznak, hogy váltságdíjat tudnak kérni érte. Mikor Dutch felvilágosítja Revy-t, hogy hiányos a terve Rock-al kapcsolatban, a lány meg akarja ölni a fiút, de Ditch megállítja, és kimegy a tússzal a fedélzetre dohányozni. Ekkor Rock úgy érzi, hogy csak Dutch-ban bízhat meg. A Black Lagoon magával viszi Rockot egészen Roanapra-ba, ahol betérnek egy kocsmába. Itt Dutch felhívja Balalaikát, és kiderül, hogy az Asahi Vállalat (az a cég, ahol Rock dolgozott Japánban) felbérelt egy zsoldos csoportot, az Extra Oldert (E.O.), akik meg is támadják a kocsmát. A nagy lövöldözésben sokan meghalnak, de a Black Lagoon emberei túlélik, és megszöknek. Dutch ott akarja hagyni a kocsmában Rock-ot, de a srác kihisztizi, hogy magukkal vigyék. Ez után kapcsolatba lépnek Okajima főnökével, aki közli a fiúval, hogy vezetővé teszi, és halottá nyilvánítja, így a váltságdíj ugrott. Ekkor Dutch Malajziában akarja kitenni Rockot, aki nagyban tiltakozik, így végül magukkal viszik a srácot. Viszont az E.O vezetője egy jól felszerelt helikopterrel követi a Lagunákat, és harcba szál velük, és a társaság csak nehezen tud megszabadulni tőle, de Rock fantasztikus ötletének köszönhetően ez is megoldódik. Mivel ezt is élve megúszták, találkoznak Balalaikával, és Dutch átadja neki a lemezt, aki továbbadja Rock főnökének. A vállalat vezetője azt akarja, hogy Rock velük tartson haza, de a srác közli vele, hogy ő már halott, és nem megy vissza, így ő már nem lesz alkalmazott, viszont ekkor Balalaika felajánlja a segítségét neki. Végül Rock odamegy a Black Lagoonhoz, és Dutch megkérdezi tőle, hogy mihez fog kezdeni, Revy pedig ad neki egy munkaajánlatot. Így csatlakozik a szelíd, japán üzletember a törvényszegő Black Lagoon kereskedelmi társasághoz. És így kezdődnek a közös kalandjaik.